B. Le ROUX - CIGDA: R

Combinatorial Inference in Geometric Data Analysis

Présentation du livre	Données et scripts R simplifiés	Scripts R complets et interfacés SPAD	Études de cas

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Les scripts R suivants sont des scripts R complets qui permettent de mettre en œuvre les méthodes présentées dans le livre en utilisant seulement le logiciel R. Chaque fichier ZIP contient 3 scripts ("main", "parameters" et "core"), des fichiers de données et un mode d'emploi.

tests combinatoires de typicalité (chapitre 3) avec 2 exemples de données et un mode d'emploi;
test géométrique de typicalité (chapitre 4);
tests de permutation pour l'homogénéité (chapitre 5).

Les scripts R interfacés SPAD proposés ci-après permettent une mise en œuvre conviviale des méthodes présentées dans le livre à partir du logiciel SPAD.

  		Pour utiliser les scripts R interfacés avec le logiciel SPAD software, commencer par installer le logiciel R indépemment du logiciel SPAD.
  		Pour utiliser le Plug-in, vous devez installer et configurer la librairie SPADR fournie avec le logiciel SPAD; pour ce faire:
			aller au menu "Outils/Préférences" et choisir l'item "Scripts/Script R", 
			puis procéder au paramétrage de R et des librairies R,
			enfin choisir le répertoire dans lequel les scripts R interfacés ont été enregistrés.

CIGDA_Comb-v1.1.R tests combinatoires de typicalité (chapitre 3);
CIGDA_Geo-v1.R test géométrique de typicalité (chapitre 4);
CIGDA_Homog-v1.R tests de permutation pour l'homogénéité (chapitre 5).